La estructura de Balaloka está constituida por personas de varios Países que ceen en la paz y en la seguridad sin uso de la violencia, procedentes de la carrera diplomática, de servicios de seguridad, del ámbito militar, de las fuerzas del orden, de la magistratura, de la sociedad civil, de la política, de la economía y de los ordenes religiosos.

La organización funciona con tres sectores fundamentales: departamento de información, iniciativas diplomáticas y acciones de defensa.